Пятый сезон (2001 год)
Последствия опытов над психикой Никиты не прошли бесследно: девушка часто видит сцены из детства, и в итоге начинает поиски отца. Никита находит папу... во главе всех Отделов; им оказывается сам мистер Джонс. Никита понимает, что ее вербовка в Отдел была изначально продумана и хорошо спланирована. Никита в ярости приходит к шефу за объяснениями, но он не в состоянии их дать: смерть Мэдлен так подкосила уже немолодого руководителя Отдела, что он сутками общается с виртуальной Мэдлен, просматривая фото и видеозаписи погибшей женщины. Никита берет управление Отделом в свои руки - теперь она решает, кого вербовать, как готовить специалистов, а кого ликвидировать. У Никиты новый напарник, который проявляет к ней повышенное внимание. но Никита по-прежнему живет воспоминаниями о Майкле. Майкл пытается забрать любимую из Отдела, но ему навязывают невозможные условия. Тогда Майкл появляется в Отделе «незваным гостем», чем навлекает на себя новые преследования. Отец прочит Никиту на свое место, и девушка, судя по всему, готова к новой роли... Никита и Майкл последний раз встречаются; их прощание происходит в аэропорту, откуда Майкл и его маленький сын навсегда улетят от прошлого. У Никиты есть возможность присоединиться к любимому и его ребенку, но Никита выбирает Отдел...
